MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT14

Total Repeats: 255

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017209	AAC	2	6	35	40	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183636
2	NC_017209	CAA	2	6	57	62	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183636
3	NC_017209	AAC	2	6	202	207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183636
4	NC_017209	TTA	2	6	449	454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183636
5	NC_017209	TTC	2	6	463	468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183636
6	NC_017209	TTC	2	6	482	487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183636
7	NC_017209	AGAAAC	2	12	517	528	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384183636
8	NC_017209	ATC	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183636
9	NC_017209	ATT	2	6	640	645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183636
10	NC_017209	TCT	2	6	845	850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183636
11	NC_017209	AGCA	2	8	862	869	50 %	0 %	25 %	25 %	384183636
12	NC_017209	GGA	2	6	980	985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384183636
13	NC_017209	AAT	2	6	1026	1031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183636
14	NC_017209	T	7	7	1059	1065	0 %	100 %	0 %	0 %	384183636
15	NC_017209	CCA	2	6	1175	1180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183636
16	NC_017209	TAAACC	2	12	1188	1199	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384183636
17	NC_017209	TA	3	6	1291	1296	50 %	50 %	0 %	0 %	384183636
18	NC_017209	ACAA	2	8	1373	1380	75 %	0 %	0 %	25 %	384183636
19	NC_017209	TAC	2	6	1399	1404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183636
20	NC_017209	TAA	2	6	1405	1410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183636
21	NC_017209	CTT	2	6	1414	1419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183636
22	NC_017209	TAC	2	6	1437	1442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183637
23	NC_017209	CAA	2	6	1447	1452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183637
24	NC_017209	TTC	2	6	1482	1487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183637
25	NC_017209	T	6	6	1527	1532	0 %	100 %	0 %	0 %	384183637
26	NC_017209	TCCC	2	8	1539	1546	0 %	25 %	0 %	75 %	384183637
27	NC_017209	TTTTCC	2	12	1591	1602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183637
28	NC_017209	TTC	2	6	1779	1784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183637
29	NC_017209	TCTT	2	8	1801	1808	0 %	75 %	0 %	25 %	384183637
30	NC_017209	TCT	3	9	1813	1821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183637
31	NC_017209	TTATCT	2	12	1828	1839	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384183637
32	NC_017209	GGT	2	6	1894	1899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384183637
33	NC_017209	TTGT	2	8	1929	1936	0 %	75 %	25 %	0 %	384183637
34	NC_017209	GTT	2	6	1955	1960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183637
35	NC_017209	GAA	2	6	1988	1993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183637
36	NC_017209	TCA	2	6	2089	2094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183637
37	NC_017209	CTT	2	6	2204	2209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183637
38	NC_017209	ACC	2	6	2226	2231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183637
39	NC_017209	CCA	2	6	2233	2238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183637
40	NC_017209	GGT	2	6	2245	2250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384183637
41	NC_017209	TTA	2	6	2251	2256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183637
42	NC_017209	TCT	2	6	2257	2262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183637
43	NC_017209	TTC	2	6	2268	2273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183637
44	NC_017209	TAT	2	6	2336	2341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183637
45	NC_017209	TGG	2	6	2376	2381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384183637
46	NC_017209	ATA	2	6	2388	2393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183637
47	NC_017209	AT	3	6	2498	2503	50 %	50 %	0 %	0 %	384183637
48	NC_017209	T	7	7	2548	2554	0 %	100 %	0 %	0 %	384183637
49	NC_017209	AAC	2	6	2637	2642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183637
50	NC_017209	CAT	2	6	2651	2656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183637
51	NC_017209	ACC	2	6	2682	2687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183637
52	NC_017209	TAC	2	6	2720	2725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183637
53	NC_017209	TAA	2	6	2727	2732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183637
54	NC_017209	AC	3	6	2788	2793	50 %	0 %	0 %	50 %	384183637
55	NC_017209	ATT	2	6	2800	2805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183637
56	NC_017209	CCA	2	6	3315	3320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183639
57	NC_017209	AATA	2	8	3324	3331	75 %	25 %	0 %	0 %	384183639
58	NC_017209	TTC	2	6	3379	3384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183639
59	NC_017209	TAA	2	6	4019	4024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183640
60	NC_017209	ATC	2	6	4032	4037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183640
61	NC_017209	T	6	6	4055	4060	0 %	100 %	0 %	0 %	384183640
62	NC_017209	T	6	6	4131	4136	0 %	100 %	0 %	0 %	384183640
63	NC_017209	AAT	2	6	4164	4169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183640
64	NC_017209	CATT	2	8	4232	4239	25 %	50 %	0 %	25 %	384183640
65	NC_017209	T	7	7	4315	4321	0 %	100 %	0 %	0 %	384183641
66	NC_017209	TCC	2	6	4350	4355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384183641
67	NC_017209	GAA	2	6	4365	4370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183641
68	NC_017209	CTTC	2	8	4375	4382	0 %	50 %	0 %	50 %	384183641
69	NC_017209	AT	3	6	4395	4400	50 %	50 %	0 %	0 %	384183641
70	NC_017209	TAATTT	2	12	4423	4434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183641
71	NC_017209	T	7	7	4432	4438	0 %	100 %	0 %	0 %	384183641
72	NC_017209	ATT	2	6	4467	4472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183641
73	NC_017209	TAC	2	6	4617	4622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183642
74	NC_017209	TCA	2	6	4638	4643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183642
75	NC_017209	TAA	2	6	4733	4738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183642
76	NC_017209	TAA	2	6	4743	4748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183642
77	NC_017209	T	7	7	4799	4805	0 %	100 %	0 %	0 %	384183642
78	NC_017209	AAT	2	6	4818	4823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183642
79	NC_017209	CCA	2	6	4824	4829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183642
80	NC_017209	AATT	2	8	4835	4842	50 %	50 %	0 %	0 %	384183642
81	NC_017209	TAAA	2	8	4859	4866	75 %	25 %	0 %	0 %	384183642
82	NC_017209	TC	3	6	5007	5012	0 %	50 %	0 %	50 %	384183642
83	NC_017209	CA	3	6	5075	5080	50 %	0 %	0 %	50 %	384183642
84	NC_017209	ATA	2	6	5156	5161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183642
85	NC_017209	TAA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183642
86	NC_017209	AAT	2	6	5271	5276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183642
87	NC_017209	TTA	2	6	5277	5282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183642
88	NC_017209	TTA	2	6	5289	5294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183642
89	NC_017209	GTC	2	6	5340	5345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183642
90	NC_017209	CTTT	2	8	5365	5372	0 %	75 %	0 %	25 %	384183642
91	NC_017209	CAT	2	6	5393	5398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183642
92	NC_017209	TCC	2	6	5431	5436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384183642
93	NC_017209	TTTCTT	2	12	5486	5497	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384183642
94	NC_017209	T	7	7	5569	5575	0 %	100 %	0 %	0 %	384183642
95	NC_017209	TTCTTT	2	12	6368	6379	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384183643
96	NC_017209	TCT	2	6	6433	6438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183643
97	NC_017209	T	6	6	6470	6475	0 %	100 %	0 %	0 %	384183643
98	NC_017209	CTT	2	6	6493	6498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183643
99	NC_017209	TGA	2	6	6527	6532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183643
100	NC_017209	A	6	6	6542	6547	100 %	0 %	0 %	0 %	384183643
101	NC_017209	ATA	2	6	6590	6595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183643
102	NC_017209	TAA	2	6	6614	6619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183643
103	NC_017209	ATC	2	6	6647	6652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183643
104	NC_017209	CTTTTT	2	12	6659	6670	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384183643
105	NC_017209	A	6	6	6708	6713	100 %	0 %	0 %	0 %	384183643
106	NC_017209	TTC	2	6	6741	6746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183643
107	NC_017209	TAA	2	6	6835	6840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183643
108	NC_017209	TTC	2	6	6843	6848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183643
109	NC_017209	TCG	2	6	6856	6861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183643
110	NC_017209	CAT	2	6	6865	6870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183643
111	NC_017209	CAA	2	6	6871	6876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183643
112	NC_017209	AAAT	2	8	6902	6909	75 %	25 %	0 %	0 %	384183643
113	NC_017209	CATT	2	8	6916	6923	25 %	50 %	0 %	25 %	384183643
114	NC_017209	T	6	6	6929	6934	0 %	100 %	0 %	0 %	384183643
115	NC_017209	TCA	3	9	7017	7025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183643
116	NC_017209	ACCA	2	8	7028	7035	50 %	0 %	0 %	50 %	384183643
117	NC_017209	CTT	2	6	7043	7048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183643
118	NC_017209	TGA	2	6	7053	7058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183643
119	NC_017209	TAG	2	6	7072	7077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183643
120	NC_017209	AT	3	6	7095	7100	50 %	50 %	0 %	0 %	384183643
121	NC_017209	ATC	2	6	7136	7141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183643
122	NC_017209	GA	3	6	7159	7164	50 %	0 %	50 %	0 %	384183643
123	NC_017209	AGA	2	6	7184	7189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183643
124	NC_017209	TAA	2	6	7199	7204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183643
125	NC_017209	TAT	2	6	7608	7613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183644
126	NC_017209	TCTT	2	8	7634	7641	0 %	75 %	0 %	25 %	384183644
127	NC_017209	ATA	2	6	7658	7663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183644
128	NC_017209	A	6	6	7663	7668	100 %	0 %	0 %	0 %	384183644
129	NC_017209	AGCATC	2	12	7700	7711	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384183644
130	NC_017209	T	6	6	7748	7753	0 %	100 %	0 %	0 %	384183644
131	NC_017209	ATA	2	6	7779	7784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183644
132	NC_017209	T	6	6	7814	7819	0 %	100 %	0 %	0 %	384183644
133	NC_017209	CAA	2	6	7827	7832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183644
134	NC_017209	AC	3	6	7855	7860	50 %	0 %	0 %	50 %	384183644
135	NC_017209	CA	3	6	7871	7876	50 %	0 %	0 %	50 %	384183644
136	NC_017209	TCC	2	6	7900	7905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384183645
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255	NC_017209	ATT	2	6	14586	14591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183657

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.